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stranted
stranted

identification of a microorganism, in particular a bacterium, present in a sample. nucleic acid (dna or rna) of the microorganism present in the sample is subjected to pcr or a different nucleic acid amplification method, utilizing one or more sets of universal primers based on a gene of the microorganism to be identified which comprises both conserved and variable regions, in particular the 16s rrna gene, the primers being chosen in conserved areas which enclose a variable region. the product of the amplification is brought into single-stranded form, if necessary, and subjected to electrophoresis by which single-stranted nucleic acids of equal lengths can be separated from each other on the basis of differences in nucleotide sequence. the electrophoresed nucleic acid is detected and its position compared with those of a set of reference nucleic acids of known microorganisms. set of suitable aids for practicing the method.
identification d'un micro-organisme, notamment d'une bactérie, présent dans un échantillon. on soumet l'acide nucléique (adn ou arn) du microorganisme présent dans l'échantillon à une réaction pcr ou à un autre procédé d'amplification d'acide nucléique, au moyen d'un ou plusieurs ensembles d'amorces universelles à base d'un gène, notamment le gène 16s arnr, du micro-organisme à identifier, lequel gène comporte à la fois des régions conservées et des régions variables, et les amorces étant choisies dans des zones conservées qui entourent une région variable. on peut, le cas échéant, conférer au produit d'amplification une forme monocaténaire, et le soumettre à l'électrophorèse de manière à séparer les uns des autres les acides nucléiques monocaténaires de longueurs égales en fonction des différences entre les séquences nucléotidiques. on détecte l'acide nucléique ayant subi l'électrophorèse et on compare sa position avec celles d'un ensemble d'acides nucléiques de référence appartenant à des micro-organismes connus. on a également prévu un ensemble de dispositifs pour la mise en oeuvre du procédé.